我国非税收入管理在实践中存在诸多不规范问题，面临一系列风险挑战。这些挑战源于管理制度的不完善以及技术、监管等因素影响。
（一）我国非税收入管理面临的风险挑战
1.资金收缴规范性缺失：随意性强，导致财政收入流失
近年来，各地频繁出现违规缓征、无据减免、应减未减、违规返还以及擅自征收等行为，直接削减了财政收入，造成了国有资产损失。有市县擅自减免土地出让金及相关费用，或违规制定优惠政策并通过垫资、变相返还等手段给予企业不当招商优惠，使得大量资金未能依法依规征收。此外，还有单位未经审批擅自设立收费项目、低价出租国有资产，甚至房产被长期转租获利。非税收入收缴的规范性缺失问题突出，征收操作随意性大，在造成财政收入严重流失的同时严重扰乱市场秩序，破坏了公平竞争的环境。
2.收入上缴财政不及时：削弱财政完整性与预算执行力
部分地方在非税收入上缴财政方面存在滞后性。具体而言，一些地区未能严格遵循规定，将中央和省级共享的非税收入及时分级纳入国库，而是采取了公款私存或绕过国库集中支付管理的方式，直接将资金拨付至预算单位。这种做法导致数亿元的行政事业性收费和罚没款未及时缴库。另外，有大量单位项目违约金、以前年度专项资金结余应缴未缴，在部门内部形成资金沉淀。一些乡镇应缴未缴的非税收入甚至达到上亿元，且未严格执行“收支两条线”管理原则，直接坐支使用了数千万元应缴收入。这些违规行为违背了财务管理的基本规定，使得大量非税收入未能有效纳入预算管理体系，损害了财政收入的完整性，降低了预算执行的透明度。
3.虚增收入问题严重：破坏财政数据真实性
近年来，很多地区通过不同手段虚增国有土地使用权出让收入，甚至通过违规征缴入库或先征后返的方式，虚增非税收入累计达数百万元。还有单位被曝出财务严重不实，虚增收支金额上千万元。这些行为破坏了财政数据的完整性和真实性，还可能导致政府基于错误信息进行决策，影响政府决策的准确性及有效性。
4.违规使用非税收入：损害公共服务与滋生腐败
部分地区和部门未经批准擅自将非税收入挪作他用，或扩大开支范围，将资金用于与项目不直接相关的支出。还有单位违规向下转嫁费用，进一步加剧了财政管理的混乱。违规使用非税收入严重损害了公共服务质量，可能造成公共资源被私人利益所侵蚀，为腐败与权力滥用提供了温床。
5.票据使用不够规范：手工征缴增大管理风险
在非税收入征缴中，电子化系统尚未全面覆盖，导致部分环节仍需手工操作。手工征缴时，票据使用不规范问题较为显著，存在票据内容填写错误、遗漏、涂改，以及票据被不当串用、外借、超范围使用、未
